Đoàn Thanh Thiếu nhi Minh Lý nằm dưới sự dẫn dắt của Minh Lý thánh hội. Ra đời vào những năm đầu của thập niên 60, thành phần tham gia chủ yếu là các em thiếu nhi con cháu bổn Đạo của chùa. Các em được tập hợp lại để cùng sinh hoạt kỹ năng, học tập giáo lý, tiếp bước con đường của bậc tiền bối. Tuy nhiên, do những thay đổi của xã hội, đất nước, việc sinh hoạt của đoàn thanh thiếu nhi bị tạm dừng.
Đến năm 2005, khi hoàn cảnh xã hội ổn định và các điều kiện đã hội tụ đủ, hoạt động sinh hoạt thanh thiếu nhi dần dần được tái khởi động; bổn đạo Minh Lý đưa con em đến tham gia nhiều hơn. Đến ngày 03/01/2007, một buổi lễ đã diễn ra để đánh dấu sự ra đời chính thức của “Tập thể Thanh Thiếu Nhi Minh Lý” (TT TTN Minh Lý).